醫學影像、標註NIfTI 轉DICOM 格式教學與範例 | 台灣精品獎-歷屆得獎名單
![醫學影像、標註NIfTI 轉DICOM 格式教學與範例](https://i.imgur.com/DERULla.jpg)
若要將NIfTI格式(*.nii或*.nii.gz)的醫學影像轉為DICOM格式,可以使用Plastimatch工具,而後續若需要進行進一步的DICOM格式編修,可以使用DCMTK工具,以下 ...
![醫學影像、標註NIfTI 轉DICOM 格式教學與範例](https://i.imgur.com/DERULla.jpg)
本篇介紹如何使用 Plastimatch、DCMTK 與 dcmqi 等工具,將 NIfTI 格式的醫學影像與標註檔案轉換為 DICOM 檔案格式。
醫學影像 NIfTI 轉 DICOM 格式若要將 NIfTI 格式(*.nii 或 *.nii.gz)的醫學影像轉為 DICOM 格式,可以使用 Plastimatch 工具,而後續若需要進行進一步的 DICOM 格式編修,可以使用 DCMTK 工具,以下是操作教學。
Plastimatch:NIfTI 轉 DICOMPlastimatch[1] 是一套開放原始碼的影像計算工具,主要提供高效能的立體醫療影像對準(volumetric registration),包含 X 光影像(X-ray)、電腦斷層掃描(CT)、磁振造影(MRI)、正子攝影(PET)。
Plastimatch 也提供了 NIfTI 轉 DICOM 的格式轉換功能,可以將 3D 的 NIfTI 醫學影像轉為一系列 2D 的 DICOM 影像,並且可以透過參數指定各種 DICOM 標籤內容,產生符合規範的 DICOM 檔案。
若在 Ubuntu Linux 中,可以透過 apt 安裝 Plastimatch[2]:
# 安裝 Plastimatch sudo apt install plastimatch以下是以 Medical Segmentation Decathlon(MSD)[3]中的 Task09_Spleen 資料集為例,將 .nii.gz 檔案轉為 DICOM 格式:
# NIfTI 轉 DICOM 格式 plastimatch convert --input Task09_Spleen/imagesTr/spleen_2.nii.gz --output-dicom output_dicom_folder --patient-id ABC123 --patient-name MYNA...DICOM | 台灣精品獎-歷屆得獎名單
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